kkatoのブログ

Ubuntu 10.04で、CUDAを使うための設定

Tue, 11 Jan 2011 20:48:16 +0900

Ubuntuのバージョンを8.10→10.04に一気にあげました。

つまりdo-release-upgradeを3回やりました。

まだCUDAのインストールまで言ってないのですが、NVIDIAのドライバーで思わぬ罠があったので報告。

9.10までは問題なかったのですが、9.10→10.04でおかしくなった模様。

結論を言うと、xserver-xorg-video-nouveauというパッケージがドライバのインストールと競合するのでアンインストールする必要があります。

つまり、10.04にアップグレード後にセーフモードで

sudo aptitude remove xserver-xorg-video-nouveau

を実行しましょう。

これだけでは不十分で、カーネルモジュールとしてnouveauが走っている可能性があるので、

sudo modprobe -r nouveau

を実行しましょう。

ちなみに、既存のCUDAインストール済みの環境のアップグレードだったので、/etc/default/linux-restricted-modules-commonは書き換え済みでした。スクラッチからインストールする人は、このファイルも書き換える必要があります。それについてはこちらを参照してください。

以上のことをやってからドライバーのインストールをすればOKです。

さ〜て、これからCUDA3.2入れるぞ〜。

追記（2011/1/14）：

カーネルモジュールの停止が必要になることがあるので、加筆しました。

linux-restricted-modules-commonの設定は必要ないことが分かったので、削除しました。

haskell-modeで関数名入力を省力化

Tue, 21 Sep 2010 12:25:49 +0900

シルバーウィーク特別企画、Emacs haskell-modeをカスタマイズしてみる。

例えば、

fibonacci :: [Integer]

と入力したあとは、当然

fibonacci n =...

と続くわけで、その「fibonacci」の部分を省力化したいですよね。

普通のHaskell-modeでもTABを2回押せばできるんですが、以下はそれが面倒くさいというニッチなニーズ向け。

で、haskell-modeには手を入れず、.emacsだけでやってみた。以下そのコード

(defun haskell-newline ()
  ""
  (interactive)
  (let ((line-start) (line-end) (s) (ss))
      (setq line-end (point))
      (if  (= line-end (line-end-position))
	  (progn (save-excursion 
		   (re-search-backward "^" nil t)
		   (setq line-start (match-beginning 0)))
	   (setq s (buffer-substring line-start line-end))
	   (end-of-line)
	   (newline)
	   (if (string-match "^\\([_a-zA-Z][_a-zA-Z0-9']*\\) *::" s)
	       (progn (setq ss (substring s (match-beginning 1) (match-end 1)))
		      (insert ss " "))))
	(newline))))
(add-hook 'haskell-mode-hook 
	  (lambda () (local-set-key (kbd "RET") 'haskell-newline)))

これで、

hogehoge :: Integer -> Integer

と入力した後に[Enter]キーを押すと次の行に自動で

hogehoge

と入ります。カーソルが行末ある状態から[Enter]を押したときだけ有効で、他は普通の改行と同じように動きます。

あと何をやっているかは、コードを読めば分かるでしょう。:-)

追記：
書き込んだ直後に気づいたのですが、型が複雑で複数行に分けて書きたいときとかにこれだと困りますね。他にもRETを乗っとると色々と不都合がありそう。

emacsマクロ：C言語でポインタ型への置き換え

Fri, 10 Sep 2010 19:32:03 +0900

Cでコード書いていて、t型の変数を後でt*型（tへのポインタ型）に変更したくなることってよくありませんか？（あまりないですか、すみません）

例えばaをintの配列のつもりで使っていたのに、後で配列へのポインタに変更したくなったりすると、
a[i]=hoge;
というのを
(*a)[i]=hoge;
に書き換えなければいけません。

こういうのが大量にあっていやになるケースに出くわしたので、emacsのマクロ書いてみました。以下そのコード


(defun f ()
  "thisandthat."
  (interactive)
  (re-search-forward "[_a-zA-z]+" nil t)
  (setq s (buffer-substring (match-beginning 0) (match-end 0)))
  (delete-region (match-beginning 0) (match-end 0))
  (insert "(*") (insert s) (insert ")")
  (goto-char (+ (match-end 0) 3))
)

あとは何か適当なキーにバインドして、置き換えたい変数の直前にカーソルを持っていって実行すればいいです。

ちなみにemacsでまともなマクロ書いたのは初めてです。

博士号を取るとはどういうことか

Mon, 16 Aug 2010 12:30:30 +0900

The illustrated guide to a Ph.D

の解説がおもしろく、妙に腑に落ちたので、訳してみることにした。
以下訳
（絵は原文をコピーしました）

---
博士号への絵付きのガイド

私は毎年秋になると新しい博士課程学生数人に「博士号とは何か」を説明するようにしている。
言葉で表すのは難しい。
だから、絵を使うこととする。
博士号への絵付きのガイドとして、以下を読んで欲しい。

---
人類の知識をすべて含む円を考えてみよう。

小学校を卒業するとちょっとだけ知るようになる。

高校を卒業するころにはさらにもう少し知るようになる。

学士を取ると、専門性が身につく。

修士号をとると、さらに専門性が深まる。

研究論文を読むことで人類の知識のふちにまでたどり着くことができる。

ふちに着いたら、ここに集中する。

このふちを数年押し続ける。

ふちが壊れるまで。

こうしてできたくぼみが博士号（Ph.D）と呼ばれる。

もちろん、今度は世界が違って見えるだろう。

だからこそ、大きな絵を忘れてはいけない。

押しつづけよう。

設定メモ：UbuntuでNISの設定

Wed, 28 Jul 2010 15:18:59 +0900

超久しぶりのブログですが、UbuntuでNISの設定をしたので、忘れないようにメモ。
ここ
http://www.tyzoh.jp/community/kkato/2009/03/31_140828.html
にも書いたのですが、情報不足だったと思うので、加筆してまとめ。

それにしてもNISの情報って少なくて苦労した。

●NIS(Network Information Service)とは何か
ログイン名とパスワードを複数のサーバ（ドメイン内）で使うための仕組み。主にLinuxなどのUNIX系OSで用いられている。
つまり同じログイン名とパスワードで複数のマシンにログインできるようになる。クラスタなんかを組むときは楽。

●簡単な仕組み
ログイン名・パスワードなどの情報を提供するのが「サーバ」で、それを利用するのが「クライアント」。サーバには2種類あって、すべての情報のもとになるのが「マスターサーバ」、マスターサーバの内容をバックアップしておくのが「スレーブサーバ」。スレーブサーバのおかげで、マスターサーバが死んでてもログインできる。

クライアントは必要に応じてサーバ（マスターまたはスレーブ）に問い合わせる。マスターは情報に変更があるとスレーブに通知する。

●Ubuntuでの設定の仕方
以下、3つのサーバで設定するものとし、サーバ名をubuntu1, ubuntu2, ubuntu3とする。
ubuntu1をマスターサーバとし、ubuntu2とubuntu3をスレーブサーバとする。
（実際にマシンの台数が少ないときは、マスター以外をすべてスレーブとしていいんじゃないかと思う。その方が頑健。）

1) まずは/etc/hostsをいじって、ubuntu1, ubuntu2, ubuntu3のアドレスを登録
2) nisをインストール
sudo aptitude install nis
3) クライアントの設定
yp.confに
ypserver ubuntu1
ypserver ubuntu2
ypserver ubuntu3
を加える。（これがクライアントが参照するサーバ）
/etc/nsswitchを編集して
passwd:         compat nis
group:          compat nis
shadow:         compat nis
とする。（こうしないと、ログイン時にnisの情報を見にいかない）

4) サーバの設定
マスターにするサーバ（ubuntu1）で
/usr/lib/yp/ypinit -m
スレーブにするサーバ（ubuntu2, ubuntu3）で、
/usr/lib/yp/ypinit -s ubuntu1
セキュリティが気になるんならypserv.securenetsを編集してアクセス元を制限できる。そのまま放っておいても動く。
5) 自動起動の設定
/etc/default/nisを開いて編集。
マスターでは
NISSERVER=master
スレーブでは
NISSERVER=slave
として、あと
NISMASTER=ubuntu1
と設定
6) cronの設定
/etc/cron.hourlyになにか書くといいらしい（よくわかってない

●ユーザを追加するとき
adduserをして
cd /var/yp
sudo make

●追記
2010/8/2
yp.confの設定が間違っていたので訂正しました。

CUDA3.0リリース

Tue, 23 Mar 2010 11:05:21 +0900

http://developer.nvidia.com/object/cuda_3_0_downloads.html

Release Highlightsを適当に訳してみる。
（網羅的ではなく、感想も含むので、注意）

Fermiアーキテクチャのサポート
C++のクラス継承とテンプレート継承のサポート　→既存コードの移植には便利そうだけど、パフォーマンスが落ちたりしないかな？
Direct3DとOpenGLの相互操作性のサポート
CUDAドライバ／ランタイムバッファの相互操作性のサポート　→何言ってるかよく分からなかったが、多分2つのレイヤーのAPIを同時に使えるということなのかな
CUBLASがBLAS1,2,3に対応
cuda-gdbがいろいろとよくなるらしい
CUDAメモリチェッカーが境界チェックやアライメントチェックをしてくれるようになる
CUDA Toolkitがバージョン付きになるので、アプリケーションが特定のバージョンを要求するようなコードがかける
CUDA C/C++カーネルが標準ELFフォーマットに変換される　→これは驚愕。GPUがPTXじゃなくても動くということか？よくわからない。
エミュレーションモードは別パッケージになる。要するににもうあまりエミュレーションは必要ないという雰囲気。デバッグの際は、WindowsならVisual Nsight、Linuxならcuda-gdbとcuda-memcheckを使え、ときたもんだ。
OpenCLはいろいろと頑張ってサポートするよ、といっている

以上超訳でした。

CUDAのアップグレードでトラブル（パート２）

Tue, 09 Feb 2010 21:14:18 +0900

今度は他のマシンをUbuntu 8.04→8.10にして、CUDA2.3をインストール。
でも、なぜかGPUを認識しないなと思っていたら、GPUの電源ケーブルが抜けていた。
これで1日くらいつぶれたかも。

そういえば、NVIDIAのCEOがこんなこと言ってたなあと思い出す。

rubyでtwitterのタイムライン取得

Fri, 05 Feb 2010 09:41:17 +0900

Ubuntu上rubyで、twitterのタイムラインを取得しようと思ったのですが、ちょっとトラブったのでメモ。

まず当然の前提として
sudo aptitude install ruby ruby-dev ruby gems
は必要

あと、
gem install twitter
で、twitterライブラリをインストール
twitterやりたいだけなら必ずしも必要でないが、コマンドラインパスワード入力のためhighlineライブラリをインストール。gemじゃなくて、aptパッケージで見つけたので、
sudo aptitude install libhighline-ruby

でもこれでサンプルコードを実行しようとすると
no such file to load -- net/https
とエラーになる。どうしてかと思いきや、ググってここで解決策発見。

なので、追加で、
sudo aptitude install libopenssl-ruby

そして、サンプルコードがこれ


#!/usr/bin/ruby

require 'rubygems'
require 'twitter'
require 'highline'

id=HighLine.new.ask("ID: ")
pw=HighLine.new.ask("Password: "){|q| q.echo='*'}

PROXY_HOST="hogehoge"
PROXY_PORT="8080"
Twitter::HTTPAuth.http_proxy( PROXY_HOST, PROXY_PORT )
auth = Twitter::HTTPAuth.new(id,pw)
t=Twitter::Base.new(auth)

t.user_timeline{:public}.each do |l|
  puts l.text + " : " + l.user.name
end

どうぶつしょうぎ

Thu, 21 Jan 2010 17:20:51 +0900

最近どうぶつしょうぎが気になっていたのですが、このくらい単純だと多分完全解析されてるんだろうなと思いググってみたら、やっぱり。

http://media.itc.u-tokyo.ac.jp/ktanaka/dobutsushogi/

あまりにも予想通りの展開でがっかり。

みなさまあけましておめでとうございます

Sat, 02 Jan 2010 20:45:20 +0900

大晦日に初めて知って感動したこと：

AKB48の48って、16進数だったんだ

CUDAのアップグレードでトラブル

Fri, 20 Nov 2009 14:52:33 +0900

Ubuntu8.06を8.10にして、CUDAを2.1から2.3にアップグレードしました。

それでSDK内のサンプルのコンパイルまではうまくいったのですが、実行しようとすると
error while loading shared libraries: libcudart.so.2: wrong ELF class: ELFCLASS32
と怒られる。

あれ？とおもって、見てみたら、64ビット版ライブラリの場所が変わったみたいですね。
（旧）/usr/local/cuda/lib
（新）/usr/local/cuda/lib64
ということで、LD_LIBRARY_PATHを書き換えてめでたく解決。

先日の講演の内容がストリーム配信されました

Mon, 16 Nov 2009 15:46:52 +0900

https://nvidiagtc.wingateweb.com/scheduler/profile.do?SESSION_ID=1166&form=searchform&ts=1258353911577

たどたどしい英語でごめんなさい。
まあでも、下手な英語でも堂々としゃべることが重要かと思っています。

CUDAインストール手順説明の更新

Wed, 21 Oct 2009 17:22:17 +0900

CUDAのインストール記事
http://www.tyzoh.jp/community/kkato/2009/03/17_113032.html

に久しぶりに追記しました。

自分でインストールしていて不足に気づいたので。
ほとんど、この説明、自分のためですね。
インストールするたびにここを見ています。

GPU Technology Conferenceで講演してきます

Mon, 28 Sep 2009 13:27:59 +0900

最近忙しくてバタバタしてたので告知が遅くなってしまいました。

GPU Technology Conference

で講演してきます。

講演の内容を要約すると、

ほらっ、速いだろ、でへっ

オリジナルTシャツをウェブでデザイン：tmix

Thu, 17 Sep 2009 11:00:37 +0900

昨日Venture BEATという集まりで、tmixという会社の方に会ってきました。

Tシャツをウェブ上で自分でデザインできるのですが、そのウェブアプリが実によくできている。かなりいい感じの直感的操作でオリジナルTシャツをデザインできます。

こちら
http://tmix.jp/

でできるので、試してみてください。

tmixさんのご厚意により、１着デザインさせていただきました。
その後、ホームページを見て思ったこと

あっ、「シベリア超特急」にしておけばよかった！

あとの祭です。